مقایسه روش Real-time PCR با استفاده از پرایمر همگانی 23s rRNA و روش کشت خون در تشخیص سپتی‌سمی

Authors

  • غلامی, علی گروه میکروب‌شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی همدان
Abstract:

Background: Bloodstream infections (BSI) have a high incidence and high mortality in the worldwide. The mortality rate is variable between 20-70%. Therefore, early and timely detection of BSI agent in clinical laboratories is necessary. The aim of this study was to determine an efficient diagnostic tool to septicemia in accompany of blood culture method by Real-time PCR (using panbacterial 23S rRNA gene). Methods: This cross-sectional study was conducted in two analytical and clinical stages in Hamadan University of Medical Sciences, Iran, from October 2014 to June 2015. In analytical stage, sensitivity (by serial dilution from 104 to 1 CFU/ml) and specificity of the primer were evaluated with the Staphylococcus aureus (as Gram positive indicator bacteria) and Escherichia coli (as Gram-negative indicator bacteria), human genome (from Hella cell culture), Candida albicans yeast and Aspergillus fumigatus fungus. In clinical stage, 121 blood samples were collected from patients suspected to sepsis in intensive care unit (ICU) from Hamadan University Hospitals. Finally, the results of Real-time PCR and blood culture methods were compared. Results: The Real-time PCR showed a sensitivity ranging from 2 to 10 target copies per reaction to the whole blood for Escherichia coli and Staphylococcus aureus respectively. The specificity of this method was evaluated and no false positive amplification was identified. 57.85% (70 cases) of the samples were positive by Real-time PCR and 13.22% (16 cases) of the samples were positive by blood culture. However, none of the cases that were positive by blood culture were negative in Real-time PCR. As well as, 44.62% (54 cases) of cases were positive by Real-time PCR but blood culture showed no bacteria in the samples, and 42.15% (51 cases) were negative by both methods. Correlation or agreement of Kappa was 0.20, that indicating poor agreement between the two methods. Conclusion: Real-time PCR is more sensitive than blood culture and also, because of high sensitivity of this primer by Real-time PCR, we can use it for screening blood samples from suspected patients of sepsis.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

مقایسه روش real-time pcr با استفاده از پرایمر همگانی ۲۳s rrna و روش کشت خون در تشخیص سپتی سمی

زمینه و هدف: در سراسر دنیا عفونت های جریان خون (blood stream infections, bsi) دارای میزان شیوع و مرگ و میر بالایی هستند که بین 20% تا 70% متغیر می باشد. بنابراین هدف از این مطالعه یافتن یک روش کارآمد برای تشخیصی سپتی سمی در کنار روش کشت، با استفاده از پرایمر همگانی 23s rrna در تشخیص بیماران مشکوک به سپتی سمی بود. روش بررسی: این مطالعه از نوع توصیفی- مقطعی می باشد که از مهر 1393 تا خرداد 1394 در...

full text

تشخیص میکرومتاستاز کارسینومای سلول کلیوی توسط مارکر CA9 با استفاده از روش Real-Time RT PCR

  چکید ه   سابقه و هدف   حدود 40 درصد از مبتلایان به سرطان کلیه حتی پس از خارج نمودن کامل کلیه(رادیکال نفرکتومی) دچار متاستاز می‌شوند. بنابراین یافتن راهی برای تشخیص شروع متاستاز بسیار ارزشمند می‌باشد. در تحقیق حاضر، امکان تشخیص میکرومتاستاز سرطان کلیه با استفاده از نشانگر( (CA9 مورد بررسی قرار گرفته است.   مواد و روش‌ها   در یک مطالعه تجربی، از 30 بیمار مبتلا به سرطان کلیه که به بیمارستان دکتر...

full text

تشخیص میکرومتاستاز با مارکر MUC2 در نمونه‌های خون و مغز استخوان بیماران سرطان پستان با روش Real -Time PCR 

Background and Aim: Tumor dissemination via blood to distant organs is the main cause of death. Therefore, there is a critical need to set up sensitive methods for the early detection of circulating tumor cells(CTCs) and disseminated tumor cells(DTCs) in peripheral blood (PB) and bone marrow(BM) specimens of breast cancer patients. The aim of this research is to study the detection of micrometa...

full text

مقایسه حساسیت دو روش real-time pcr و rt-pcr برای تشخیص ویروس بیماری زای طیور

بیماری نیوکاسل یکی از مخرب ترین بیماری های ویروسی طیور در سرتاسر جهان است. با توجه به اینکه روش های سنتی قابلیت محدودی در کنترل این بیماری دارند، هدف از انجام این مطالعه استفاده از تکنولوژی های نوین برای تشخیص به موقع بیماری جهت کاهش خسارت پیش روی صنعت طیور می باشد. استخراج rna از واکسن نیوکاسل سویه b1 و با استفاده از کیت rnease mini (شرکت کیاژن، آمریکا) و بر اساس دستورالعمل شرکت سازنده انجام ش...

15 صفحه اول

راه اندازی روش Real-time PCR برای تشخیص و تعیین کمی ویروس سرخک با استفاده از ژن F

سابقه و هدف: با وجود کنترل بیماری سرخک در جهان، اما گزارش‌هایی از ابتلا به این ویروس در جمعیت‌های واکسینه شده وجود دارد. بنابراین تشخیص دقیق و به‌موقع این ویروس ضروری است. روش‌های جدید مولکولی در تشخیص ویروس ارائه شده است که توان تعیین مقدار این ویروس را ندارند. هدف از این پژوهش راه اندازی روش Real-time PCR با استفاده از ژن F ویروس سرخک می‌باشد. مواد و روش‌ها: این مطالعه با ط...

full text

راه اندازی روش Real-time PCR برای تشخیص و تعیین کمی ویروس سرخک با استفاده از ژن F

سابقه و هدف: با وجود کنترل بیماری سرخک در جهان، اما گزارش‌هایی از ابتلا به این ویروس در جمعیت‌های واکسینه شده وجود دارد. بنابراین تشخیص دقیق و به‌موقع این ویروس ضروری است. روش‌های جدید مولکولی در تشخیص ویروس ارائه شده است که توان تعیین مقدار این ویروس را ندارند. هدف از این پژوهش راه اندازی روش Real-time PCR با استفاده از ژن F ویروس سرخک می‌باشد. مواد و روش‌ها: این مطالعه با ط...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 73  issue None

pages  784- 790

publication date 2016-02

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Keywords

No Keywords

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023